Laurence Rageot – ADCVL

Auteur/autrice : Laurence Rageot

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ADCVL Codes et logiciels Formation ADCVL

[Formation] ‘Git de survie’ – 15 septembre 2025 – Orléans

Cette formation a pour objectif de vous faire connaître et maîtriser les commandes essentielles de l’outil de gestion de version Git. À la fin de la journée vous saurez comment versionner votre code et comment collaborer à un projet collectif.

Public visé

Ingénieurs, techniciens, enseignants-chercheurs, chercheurs, doctorants.

Cette formation s’adresse en priorité à des personnes qui écrivent ou modifient des scripts, du code source (tous niveaux). Les personnes qui sont amenées à utiliser GitLab ou GitHub pour écrire de la documentation sont également bienvenues.

Elle est destinée à ceux et celles qui ne connaissent pas l’outil ou ne sont pas tout à fait à l’aise avec Git.

La formation est gratuite pour tous les personnels des partenaires de l’ADCVL : CNRS, Université d’Orléans, Université de Tours, BRGM, INSA-CVL, INRAE Val de Loire, Inserm

Intervenants
Programme

9h30 – 10h

Git qu’est ce que c’est ? D’où ça vient ? A quoi ça sert ?

10h – 12h30

  • Commandes git essentielles (init, add, commit)
  • Les états et les différences (status, log, diff)
  • Introduction aux trois états de git (modified, staged, committed)
  • .gitignore
  • Revenir en arrière (stash, revert)
  • Les branches (branch)

14h – 17h

  • Participer à un dépôt distant (clone, fetch, push, pull)
  • Gestion des conflits
  • merge vs rebase

17h – 17h30

  • Questionnaire rapide
  • Échanges/discussions sur le contenu de la formation
Pré-requis
  • ne pas être allergique à la ligne de commande
  • avoir une installation git fonctionnelle d’installé sur sa machine
  • avoir un éditeur de texte (nous utiliserons VS Code ou Codium)
La formation est complète !

Pour toute demande d’information, contacter : adcvl@pu-cvl.fr

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Codes et logiciels Formation Formation ADCVL

[Formation] ‘Git de survie’ – 12 juin 2025 – MSH Val de Loire

Cette formation a pour objectif de vous faire connaître et maîtriser les commandes essentielles de l’outil de gestion de version Git. À la fin de la journée vous saurez comment versionner votre code et comment collaborer à un projet collectif.

Public visé

Ingénieurs, techniciens, enseignants-chercheurs, chercheurs, doctorants.

Cette formation s’adresse en priorité à des personnes qui écrivent ou modifient des scripts, du code source (tous niveaux). Les personnes qui sont amenées à utiliser GitLab ou GitHub pour écrire de la documentation sont également bienvenues.

Elle est destinée à ceux et celles qui ne connaissent pas l’outil ou ne sont pas tout à fait à l’aise avec Git.

La formation est gratuite pour tous les personnels des partenaires de l’ADCVL : CNRS, Université d’Orléans, Université de Tours, BRGM, INSA-CVL, INRAE Val de Loire, Inserm

Intervenants
Programme

9h30 – 10h

Git qu’est ce que c’est ? D’où ça vient ? A quoi ça sert ?

10h – 12h30

  • Commandes git essentielles (init, add, commit)
  • Les états et les différences (status, log, diff)
  • Introduction aux trois états de git (modified, staged, committed)
  • .gitignore
  • Revenir en arrière (stash, revert)
  • Les branches (branch)

14h – 17h

  • Participer à un dépôt distant (clone, fetch, push, pull)
  • Gestion des conflits
  • merge vs rebase

17h – 17h30

  • Questionnaire rapide
  • Échanges/discussions sur le contenu de la formation
Pré-requis
  • ne pas être allergique à la ligne de commande

La MSH pourra mettre à disposition des ordinateurs configurés avec les outils nécessaires pour la formation. Si vous préférez utiliser votre propre machine, assurez-vous d’avoir :

LA FORMATION EST COMPLETE
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Codes et logiciels Entrepôt de données Formation ADCVL

[Formation] Comment partager vos données et vos codes et logiciels – 21/05/2025 – Orléans

La science ouverte est la diffusion sans entrave des résultats, des méthodes et des produits de la recherche scientifique. L’un des premiers aspects consiste en la mise en ligne en libre accès des publications de recherche, des données et des codes et logiciels. Il s’agit de l’une des manières de partager les données de recherche le plus largement possible et de valoriser les recherches.

Cette formation a pour objectif d’expérimenter le partage des données et des codes et logiciels par la découverte des bonnes pratiques et l’expérimentation du dépôt dans un entrepôt de données et de la création des métadonnées de partage d’un code ou logiciel.

Programme
  • Présentation des bonnes pratiques pour la gestion et le partage de vos données et de vos codes et logiciel
  • Mise en pratique de dépôt des données dans un entrepôt
  • Mise en pratique de préparation des codes et logiciels
  • Expérimentation de lier les données, codes et logiciels aux publications
Public

Doctorants des universités de Tours ou d’Orléans

Intervenants

Clara Monmarché, Chargée des plans de gestion de données, Atelier de la donnée Centre-Val de Loire
Rémi Ossant, Chargé du suivi des codes sources et logiciels pour l’Atelier de la donnée Centre-Val de Loire et C-VALO

Inscriptions

Inscriptions sur ADUM

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Codes et logiciels Entrepôt de données Formation ADCVL

[Formation] Comment partager vos données et vos codes et logiciels – 15/05/2025 – Tours

La science ouverte est la diffusion sans entrave des résultats, des méthodes et des produits de la recherche scientifique. L’un des premiers aspects consiste en la mise en ligne en libre accès des publications de recherche, des données et des codes et logiciels. Il s’agit de l’une des manières de partager les données de recherche le plus largement possible et de valoriser les recherches.

Cette formation a pour objectif d’expérimenter le partage des données et des codes et logiciels par la découverte des bonnes pratiques et l’expérimentation du dépôt dans un entrepôt de données et de la création des métadonnées de partage d’un code ou logiciel.

Programme
  • Présentation des bonnes pratiques pour la gestion et le partage de vos données et de vos codes et logiciel
  • Mise en pratique de dépôt des données dans un entrepôt
  • Mise en pratique de préparation des codes et logiciels
  • Expérimentation de lier les données, codes et logiciels aux publications
Public

Doctorants des universités de Tours ou d’Orléans

Intervenants

Clara Monmarché, Chargée des plans de gestion de données, Atelier de la donnée Centre-Val de Loire
Rémi Ossant, Chargé du suivi des codes sources et logiciels pour l’Atelier de la donnée Centre-Val de Loire et C-VALO

Inscriptions

Inscriptions sur ADUM

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Centre de ressources Entrepôt de données

Cat OPIDoR caractérise finement les entrepôts de données en adoptant une recommandation de la RDA

Pour aider les utilisateurs de Cat OPIDoR à identifier et sélectionner l’entrepôt de données adapté à leurs besoins, l’équipe de l’Inist a mis à jour les informations sur les entrepôts recensés dans le catalogue. Cette mise à jour s’appuie sur une recommandation de la Research Data Alliance (RDA).

En effet, Cat OPIDoR a adopté les attributs de description proposés par la recommandation RDA Common Descriptive Attributes of Research Data Repositories pour caractériser plus finement les entrepôts de données signalés dans le catalogue et offrir à ses utilisateurs des critères pour sélectionner un entrepôt de confiance où déposer leurs données.

Chaque page des 184 entrepôts répertoriés affiche désormais une fiche récapitulative avec ses caractéristiques spécifiques comme les formats de fichiers acceptés, les schémas de métadonnées, le niveau de curation, les modalités de dépôt, les licences utilisées ou encore la politique de conservation des données.

Les différents filtres mis en place sur la page Entrepôt de données de Cat OPIDoR offrent à chaque utilisateur la possibilité de spécifier les critères pertinents pour sélectionner un dépôt de données parmi tous ceux référencés dans le catalogue.

Une « adoption story »

Suite à ce travail, l’équipe Cat OPIDoR a publié son retour d’expérience sur le site de la Research Data Alliance : « Improving the description of data repositories in the French registry Cat OPIDoR through adopting RDA Common Descriptive Attributes of Research Data Repositories Recommendation ». Cet article (« adoption story ») témoigne de l’importance des travaux menés au sein de la Research Data Alliance et de l’utilité de ses recommandations. Il met en avant les bénéfices concrets apportés à Cat OPIDoR par cette recommandation, notamment une plus grande transparence des pratiques des entrepôts et l’amélioration de l’expérience utilisateur permettant aux chercheurs d’évaluer l’adéquation d’un entrepôt et des données qu’il gère à leurs besoins.

Aller sur Cat OPIDoR…

Lire le retour d’expérience Improving the description of data repositories in the French registry Cat OPIDoR through adopting RDA Common Descriptive Attributes of Research Data Repositories Recommendation 

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Ethique et juridique FAIR Formation Préservation et sécurité Science ouverte

Action nationale de formation « Gestion de projet sur les sources numériques en SHS » – 7-10 octobre 2025

La recherche en SHS prend désormais en compte l’arrivée massive de sources numérisées ou nativement numériques. L’hétérogénéité des formats, la multiplicité des normes et standards ou la détérioration accélérée des supports montrent bien que l’ère numérique impose un nouveau cadre de travail à la recherche en sciences humaines et sociales.

Aussi, une nouvelle édition de l’action nationale de formation « Gestion de projet sur les sources numériques en SHS » est proposée du 7 au 10 octobre 2025 au Centre Paul-Langevin d’Aussois (73).

Enseignant-chercheur, chercheur, doctorant, ingénieur, technicien, bibliothécaire, impliqués à court ou moyen terme dans un projet de numérisation des sources de la recherche, cette formation vise à vous présenter les nouveaux contextes et cadres de travail et à vous sensibiliser aux différents enjeux du monde des données numériques.

Cette ANF donnera une formation concrète et pratique, introduisant aux principaux aspects de la gestion de projets de sources numériques de la recherche en sciences humaines et sociales. Pour aider dans l’organisation de ces projets souvent multidisciplinaires, elle permettra de se situer dans le paysage numérique et de s’orienter en fonction des objectifs et des attendus du domaine (principes FAIR, Science Ouverte, etc.). Afin de permettre de mieux comprendre les questions relatives à la gestion d’un projet, elle s’appuiera sur une mise en situation avec un cas pratique.

Cette formation est organisée par la MSH Val de Loire et par des acteurs des « Humanités numériques ». Elle bénéficie du soutien de la commission nationale de formation permanente du CNRS et de CNRS Sciences humaines & sociales.

INSCRIPTIONS OUVERTES JUSQU’AU 23 MAI 2025

Pour toutes informations et inscriptions : https://anf.msh-vdl.fr/

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ADCVL Codes et logiciels

Enquête sur les pratiques et les besoins de la communauté scientifique autour des codes sources et logiciels

L’ADCVL et C-VaLo s’associent, dans le cadre du Pôle Universitaire d’Innovation Loire Valley Innov’ pour une enquête s’adressant à l’ensemble des chercheurs, des doctorants et des personnels d’appui à la recherche des institutions partenaires : université de Tours, université d’Orléans, CNRS, CHRU de Tours, CHU d’Orléans, INRAE, BRGM, INSERM et INSA Centre Val de Loire.

L’objectif de cette enquête est de mieux connaître les pratiques et les besoins des chercheurs et des personnels de recherche autour de la production, de l’utilisation et de la valorisation des codes sources et logiciels.

Le résultat permettra de dresser un premier bilan des habitudes de travail du monde de la recherche autour de ce point dans la région Centre-Val de Loire mais aussi des besoins de formation et d’accompagnement de la communauté scientifique. Enfin elle permettra une prise de contact avec les équipes de recherche productrices de codes sources et logiciels qui le souhaitent.

https://adcvl.pu-cvl.fr/valorisez-vos-logiciels-maximisez-votre-recherche/

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Ethique et juridique INRAE Science ouverte

INRAE – Pratiques intègres de publication scientifique à l’heure de la science ouverte. Note de recommandations

« Le présent document a pour objectif de fournir aux scientifiques d’INRAE impliqués dans le processus de publication scientifique quelques recommandations pour une pratique intègre de la publication dans un contexte de science ouverte […] . Ce texte est le fruit de la réflexion d’un groupe de travail réuni à l’initiative de la Délégation à la déontologie, l’intégrité scientifique et l’éthique des projets de recherche, conjointement à la Direction pour la Science Ouverte (DipSO) et constitué de scientifiques, d’édit.eur.rice.s de revues scientifiques et techniques portées par INRAE et de représentant.e.s de la Délégation ainsi que de membres de la Direction pour la Science Ouverte, de la Direction de l’Évaluation et de la Direction des Affaires Juridiques. (…) »

Lire les recommandations

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Ethique et juridique Formation INRAE

Intégrité et science ouverte – formation e-learning OSCAR d’INRAE

En encourageant la transparence, la reproductibilité et la rigueur à chaque étape du processus de recherche, la science ouverte participe au respect des principes de l’intégrité scientifique.

Toutefois, si la science ouverte offre des opportunités pour développer des pratiques plus vertueuses et plus transparentes, en permettant une recherche réutilisable et reproductible, elle peut aussi présenter des risques accrus pour les scientifiques de se voir piller, plagier ou détourner leurs travaux. Dès lors, comment mobiliser au mieux la science ouverte au service de l’intégrité, tout en se prémunissant contre les risques ?

Pour répondre à cette question, INRAE propose un nouveau module de la formation e-learning OSCAR. Ce dernier-né explore la question de l’intégrité scientifique dans un contexte de science ouverte.

https://callisto-formation.fr/course/view.php?id=887

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Entrepôt de données Inserm Science ouverte

Comment et pourquoi publier son protocole de recherche ?

Le blog sur la science ouverte réalisé par les documentalistes de la bibliothèque du CeRIS (Centre de Ressources en Information Scientifique) de l’Institut Pasteur publie un article sur l’intérêt de publier son protocole de recherche, les façons de le partager et les entrepôts existants

https://openscience.pasteur.fr/2025/03/05/comment-et-pourquoi-publier-son-protocole-de-recherche/